常规项目
菌落总数、大肠菌群、大肠埃希氏菌、霉菌、酵母菌
致病菌
沙门氏菌、单核增生李斯特氏菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌、霍乱弧菌、创伤弧菌、弯曲杆菌属、克洛诺杆菌属（阪崎肠杆菌）、绿脓杆菌、溶血性链球菌、肉毒梭菌、产气荚膜梭菌、蜡样芽孢杆菌、致泻大肠埃希氏菌、溶藻弧菌
其他
军团菌、乳酸菌、罐头食品的商业无菌、嗜渗酵母、粪链球菌、粪大肠菌群、厌氧菌落总数、厌氧亚硫酸盐还原菌、需氧嗜温菌芽孢、厌氧嗜温菌芽孢、嗜热嗜酸菌、嗜热菌落总数等
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